MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bacillus cereus biovar anthracis str. CI plasmid pBAslCI14

Total Repeats: 214

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014333	TGA	2	6	146	151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300885231
2	NC_014333	TTC	2	6	258	263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300885231
3	NC_014333	TCT	2	6	434	439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300885231
4	NC_014333	CTT	2	6	475	480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300885232
5	NC_014333	TCT	3	9	508	516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300885232
6	NC_014333	TCA	2	6	529	534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300885232
7	NC_014333	TA	3	6	586	591	50 %	50 %	0 %	0 %	300885232
8	NC_014333	TTC	2	6	642	647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300885232
9	NC_014333	AT	3	6	660	665	50 %	50 %	0 %	0 %	300885232
10	NC_014333	CTC	2	6	708	713	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300885232
11	NC_014333	CCT	2	6	790	795	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300885233
12	NC_014333	TCT	2	6	827	832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300885233
13	NC_014333	ACC	2	6	835	840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300885233
14	NC_014333	TCTTCA	2	12	923	934	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	300885233
15	NC_014333	TCA	2	6	945	950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300885233
16	NC_014333	CTC	2	6	985	990	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300885233
17	NC_014333	TCA	2	6	1007	1012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300885233
18	NC_014333	ATC	2	6	1027	1032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300885233
19	NC_014333	TAT	2	6	1033	1038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300885233
20	NC_014333	GAT	2	6	1039	1044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300885233
21	NC_014333	ATC	2	6	1087	1092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300885233
22	NC_014333	ATCT	2	8	1105	1112	25 %	50 %	0 %	25 %	300885233
23	NC_014333	T	6	6	1136	1141	0 %	100 %	0 %	0 %	300885233
24	NC_014333	GTT	2	6	1155	1160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300885233
25	NC_014333	ACT	2	6	1172	1177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300885233
26	NC_014333	GAA	2	6	1190	1195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300885234
27	NC_014333	CTT	2	6	1254	1259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300885234
28	NC_014333	TAA	2	6	1274	1279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300885234
29	NC_014333	TCA	2	6	1282	1287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300885234
30	NC_014333	TCTTT	2	10	1289	1298	0 %	80 %	0 %	20 %	300885234
31	NC_014333	GAA	2	6	1323	1328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300885234
32	NC_014333	CTAG	2	8	1330	1337	25 %	25 %	25 %	25 %	300885234
33	NC_014333	AGT	2	6	1346	1351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300885234
34	NC_014333	AATA	2	8	1383	1390	75 %	25 %	0 %	0 %	300885234
35	NC_014333	TCTCAA	2	12	1415	1426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300885234
36	NC_014333	CTT	2	6	1523	1528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300885235
37	NC_014333	AGA	2	6	1563	1568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300885235
38	NC_014333	AAC	2	6	1578	1583	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300885235
39	NC_014333	CCG	2	6	1604	1609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300885235
40	NC_014333	ACT	2	6	1674	1679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300885235
41	NC_014333	CAT	2	6	1700	1705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300885235
42	NC_014333	TCA	2	6	1732	1737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300885235
43	NC_014333	CTT	2	6	1740	1745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300885235
44	NC_014333	TCC	2	6	1831	1836	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300885235
45	NC_014333	CTT	2	6	1872	1877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300885235
46	NC_014333	ATT	2	6	1897	1902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300885235
47	NC_014333	TC	3	6	1954	1959	0 %	50 %	0 %	50 %	300885236
48	NC_014333	TAA	2	6	1961	1966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300885236
49	NC_014333	CAA	2	6	1990	1995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300885236
50	NC_014333	CCT	2	6	2032	2037	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300885236
51	NC_014333	ATG	2	6	2232	2237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300885236
52	NC_014333	T	6	6	2261	2266	0 %	100 %	0 %	0 %	300885236
53	NC_014333	C	6	6	2301	2306	0 %	0 %	0 %	100 %	300885236
54	NC_014333	TTC	2	6	2309	2314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300885236
55	NC_014333	ACG	2	6	2315	2320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300885236
56	NC_014333	TCCT	2	8	2356	2363	0 %	50 %	0 %	50 %	300885237
57	NC_014333	TCTT	2	8	2412	2419	0 %	75 %	0 %	25 %	300885237
58	NC_014333	TTA	2	6	2475	2480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300885237
59	NC_014333	CTT	2	6	2482	2487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300885237
60	NC_014333	T	6	6	2510	2515	0 %	100 %	0 %	0 %	300885237
61	NC_014333	TCT	2	6	2541	2546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300885237
62	NC_014333	TTC	2	6	2561	2566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300885237
63	NC_014333	GTC	2	6	2568	2573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300885237
64	NC_014333	AAT	2	6	2962	2967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300885238
65	NC_014333	TTA	2	6	2982	2987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300885238
66	NC_014333	AAG	2	6	3053	3058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300885238
67	NC_014333	ATC	2	6	3078	3083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300885238
68	NC_014333	GCC	2	6	3172	3177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300885238
69	NC_014333	TAA	2	6	3227	3232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300885238
70	NC_014333	CAA	2	6	3238	3243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300885238
71	NC_014333	CAA	2	6	3334	3339	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300885238
72	NC_014333	CAA	3	9	3352	3360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300885238
73	NC_014333	AGA	2	6	3402	3407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300885238
74	NC_014333	GAAG	2	8	3412	3419	50 %	0 %	50 %	0 %	300885238
75	NC_014333	GAAG	2	8	3423	3430	50 %	0 %	50 %	0 %	300885238
76	NC_014333	A	7	7	3437	3443	100 %	0 %	0 %	0 %	300885238
77	NC_014333	AAC	2	6	3455	3460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300885238
78	NC_014333	ATGA	2	8	3481	3488	50 %	25 %	25 %	0 %	300885238
79	NC_014333	TCA	2	6	3504	3509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300885238
80	NC_014333	TTC	2	6	3535	3540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300885238
81	NC_014333	TTC	2	6	3547	3552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300885238
82	NC_014333	GTAA	2	8	3918	3925	50 %	25 %	25 %	0 %	300885239
83	NC_014333	AAT	2	6	3929	3934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300885239
84	NC_014333	ATG	2	6	3991	3996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300885239
85	NC_014333	AGA	2	6	4030	4035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300885239
86	NC_014333	GAA	2	6	4105	4110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300885239
87	NC_014333	AT	3	6	4159	4164	50 %	50 %	0 %	0 %	300885239
88	NC_014333	ATC	2	6	4205	4210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300885239
89	NC_014333	ATT	2	6	4466	4471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300885240
90	NC_014333	CGC	2	6	4507	4512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300885240
91	NC_014333	T	7	7	4546	4552	0 %	100 %	0 %	0 %	300885240
92	NC_014333	T	6	6	4576	4581	0 %	100 %	0 %	0 %	300885240
93	NC_014333	GAT	2	6	4624	4629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300885240
94	NC_014333	TAT	2	6	4630	4635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300885240
95	NC_014333	A	6	6	4639	4644	100 %	0 %	0 %	0 %	300885240
96	NC_014333	CA	3	6	4705	4710	50 %	0 %	0 %	50 %	300885240
97	NC_014333	AGG	2	6	4761	4766	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300885240
98	NC_014333	TGG	2	6	4769	4774	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300885240
99	NC_014333	GGC	2	6	6217	6222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300885241
100	NC_014333	TAGA	2	8	6261	6268	50 %	25 %	25 %	0 %	300885241
101	NC_014333	TA	3	6	6295	6300	50 %	50 %	0 %	0 %	300885241
102	NC_014333	AAT	2	6	6315	6320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300885241
103	NC_014333	TA	3	6	6337	6342	50 %	50 %	0 %	0 %	300885241
104	NC_014333	TAA	2	6	6366	6371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300885241
105	NC_014333	TCA	2	6	6969	6974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300885242
106	NC_014333	GCT	2	6	6979	6984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300885242
107	NC_014333	GCTT	2	8	7093	7100	0 %	50 %	25 %	25 %	300885242
108	NC_014333	AACT	2	8	7101	7108	50 %	25 %	0 %	25 %	300885242
109	NC_014333	TCA	2	6	7126	7131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300885242
110	NC_014333	TAC	2	6	7142	7147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300885242
111	NC_014333	TCT	2	6	7213	7218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300885242
112	NC_014333	TAT	2	6	7250	7255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300885242
113	NC_014333	ATC	2	6	7299	7304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300885242
114	NC_014333	AAC	2	6	7305	7310	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300885242
115	NC_014333	ATTC	2	8	7361	7368	25 %	50 %	0 %	25 %	300885242
116	NC_014333	T	6	6	7383	7388	0 %	100 %	0 %	0 %	300885242
117	NC_014333	TC	3	6	7407	7412	0 %	50 %	0 %	50 %	300885242
118	NC_014333	TG	3	6	7428	7433	0 %	50 %	50 %	0 %	300885242
119	NC_014333	TCT	2	6	7441	7446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300885242
120	NC_014333	TGCT	2	8	7493	7500	0 %	50 %	25 %	25 %	300885242
121	NC_014333	ACG	2	6	7587	7592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300885242
122	NC_014333	CTT	2	6	7660	7665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300885242
123	NC_014333	TGT	2	6	7712	7717	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300885242
124	NC_014333	TAG	2	6	7796	7801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300885242
125	NC_014333	TCT	2	6	7861	7866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300885242
126	NC_014333	CTT	2	6	7923	7928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300885242
127	NC_014333	AGA	2	6	7929	7934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300885242
128	NC_014333	TAC	2	6	7949	7954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300885242
129	NC_014333	GTC	2	6	8008	8013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300885242
130	NC_014333	CAC	2	6	8165	8170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300885242
131	NC_014333	CTTG	2	8	8832	8839	0 %	50 %	25 %	25 %	300885243
132	NC_014333	TACA	2	8	8857	8864	50 %	25 %	0 %	25 %	300885243
133	NC_014333	CTA	2	6	8904	8909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300885243
134	NC_014333	ATC	2	6	8917	8922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300885243
135	NC_014333	GAT	2	6	9376	9381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300885244
136	NC_014333	CTT	2	6	9430	9435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300885244
137	NC_014333	TTCA	2	8	9443	9450	25 %	50 %	0 %	25 %	300885244
138	NC_014333	ACCA	2	8	9459	9466	50 %	0 %	0 %	50 %	300885244
139	NC_014333	A	7	7	9466	9472	100 %	0 %	0 %	0 %	300885244
140	NC_014333	ATT	2	6	9500	9505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300885244
141	NC_014333	TATC	2	8	9575	9582	25 %	50 %	0 %	25 %	300885245
142	NC_014333	CT	3	6	9603	9608	0 %	50 %	0 %	50 %	300885245
143	NC_014333	AGTC	2	8	9618	9625	25 %	25 %	25 %	25 %	300885245
144	NC_014333	CTCA	2	8	9643	9650	25 %	25 %	0 %	50 %	300885245
145	NC_014333	ATC	2	6	9683	9688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300885245
146	NC_014333	TGT	2	6	9690	9695	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300885245
147	NC_014333	ATC	2	6	9713	9718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300885245
148	NC_014333	TC	3	6	9734	9739	0 %	50 %	0 %	50 %	300885245
149	NC_014333	GAA	2	6	9751	9756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300885245
150	NC_014333	TCT	2	6	9774	9779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300885245
151	NC_014333	TCT	2	6	10092	10097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300885246
152	NC_014333	AT	3	6	10114	10119	50 %	50 %	0 %	0 %	300885246
153	NC_014333	TGAT	2	8	10194	10201	25 %	50 %	25 %	0 %	300885246
154	NC_014333	ACC	2	6	10332	10337	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300885246
155	NC_014333	GCT	2	6	10360	10365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300885246
156	NC_014333	CTT	2	6	10378	10383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300885246
157	NC_014333	CAA	2	6	10403	10408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300885246
158	NC_014333	TCC	2	6	10410	10415	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300885246
159	NC_014333	ATCC	2	8	10480	10487	25 %	25 %	0 %	50 %	300885246
160	NC_014333	CAA	2	6	10619	10624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300885246
161	NC_014333	CAC	2	6	10679	10684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300885246
162	NC_014333	CAGT	2	8	10694	10701	25 %	25 %	25 %	25 %	300885246
163	NC_014333	TAA	2	6	10718	10723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300885246
164	NC_014333	ATG	2	6	10732	10737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300885246
165	NC_014333	ATG	2	6	10786	10791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300885246
166	NC_014333	ATA	2	6	10798	10803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300885246
167	NC_014333	TGT	2	6	10867	10872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300885246
168	NC_014333	TC	4	8	10877	10884	0 %	50 %	0 %	50 %	300885246
169	NC_014333	ATG	2	6	10922	10927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300885246
170	NC_014333	ATG	2	6	10948	10953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300885246
171	NC_014333	ACC	2	6	11014	11019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300885246
172	NC_014333	TGC	2	6	11106	11111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300885246
173	NC_014333	ACC	2	6	11142	11147	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300885246
174	NC_014333	GAAGT	2	10	11248	11257	40 %	20 %	40 %	0 %	300885246
175	NC_014333	TCAT	2	8	11281	11288	25 %	50 %	0 %	25 %	300885246
176	NC_014333	TGC	2	6	11307	11312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300885246
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178	NC_014333	AAT	2	6	11407	11412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300885246
179	NC_014333	TGT	2	6	11434	11439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300885246
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181	NC_014333	TCT	2	6	11461	11466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300885246
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183	NC_014333	TAATCC	2	12	11523	11534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300885246
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193	NC_014333	CTG	2	6	11831	11836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300885246
194	NC_014333	CTT	2	6	11951	11956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300885246
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.